激光治疗跖疣通常会有轻微疼痛感，但多数人可以耐受。疼痛程度因人而异，与疣体大小、深度及个人痛阈有关。
激光治疗时，高温光束会汽化疣体组织，可能产生类似橡皮筋弹射的刺痛感。表浅的小疣体治疗时间短，疼痛感较轻；深部或大面积疖疣可能需要多次照射，不适感会更明显。部分患者治疗后会出现局部红肿、灼热感，这些属于正常反应，通常1-3天逐渐消退。冷冻治疗相比激光的瞬时疼痛更剧烈但持续时间短，而激光的痛感更持久但强度较低。儿童或痛觉敏感者可在治疗前使用表面麻醉剂减轻不适。
治疗后需保持创面干燥清洁，避免穿硬底鞋摩擦。若出现持续剧烈疼痛、渗液或发热，应及时复诊排除感染。恢复期间建议穿宽松透气的棉袜，用环形减压垫分散足底压力。
