盐酸舍曲林的副作用多数较轻微，常见副作用有胃肠不适、头晕、睡眠障碍、口干等，通常随用药时间延长逐渐减轻。
可能出现恶心、腹泻或食欲下降，建议餐后服药减轻症状，严重时可遵医嘱调整剂量或联用奥美拉唑等胃肠保护药物。
中枢神经系统反应多发生在用药初期，避免驾驶或高空作业，必要时医生可能推荐睡前服药或换用氟西汀等副作用较小的药物。
部分患者出现失眠或嗜睡，需调整服药时间，失眠者可短期联用唑吡坦，嗜睡者建议晨起服药。
包括性欲减退或射精延迟，发生率较高但可逆，可考虑减量或换用米氮平等对性功能影响较小的药物。
用药期间出现心悸、震颤等严重反应需立即就医，避免突然停药诱发撤药综合征，定期复诊评估疗效与安全性。
