牙龈根部发黑可通过牙周基础治疗、药物辅助治疗、激光治疗、手术修复等方式改善，通常与色素沉积、牙结石刺激、牙周炎、重金属中毒等因素有关。
通过超声波洁治去除牙结石和菌斑，配合龈下刮治清除牙周袋内感染物，适用于色素沉积或轻度牙周炎导致的牙龈发黑。
牙龈发黑若伴随炎症可使用甲硝唑片、阿莫西林胶囊、复方氯己定含漱液等药物，控制感染后色素可能减轻。
铒激光或半导体激光可选择性清除黑色素细胞，改善外源性着色，治疗过程出血少且精准度高。
重度牙周炎导致的牙龈坏死需行牙龈切除术，汞合金纹身等重金属沉积需手术切除病变组织。
日常建议使用软毛牙刷避免机械刺激，定期口腔检查可早期发现病变，吸烟者需戒烟防止尼古丁加重色素沉着。
