新生儿呼吸暂停多数情况下可以治愈，具体预后与病因、干预时机及基础疾病严重程度有关，主要治疗方式包括体位管理、原发病治疗、呼吸支持及药物干预。
早产儿中枢发育不完善导致的呼吸暂停，可通过俯卧位或侧卧位改善通气，配合触觉刺激唤醒呼吸，无须药物干预。
继发于感染或代谢紊乱的呼吸暂停需针对性治疗，如败血症使用抗生素，低血糖静脉补糖，通常伴随发热、喂养困难等症状。
频繁发作需无创通气支持，持续正压通气可维持气道开放，严重病例可能需要气管插管，常与支气管肺发育不良等疾病相关。
甲基黄嘌呤类药物如枸橼酸咖啡因可刺激呼吸中枢，需监测心率及胃肠道反应，严重贫血者需输血治疗。
家长需定期监测呼吸频率，避免过度包裹导致窒息风险，出院后应使用家庭监护仪，母乳喂养有助于降低感染概率。
