根尖囊肿可通过根管治疗、囊肿摘除术、药物治疗、定期复查等方式治疗。根尖囊肿通常由龋齿未及时治疗、牙髓坏死、根尖周感染、外伤等因素引起。
早期根尖囊肿可尝试保留患牙的根管治疗，通过清除感染牙髓和根管内腐败物质消除炎症源，治疗期间可能出现短暂胀痛，可遵医嘱使用阿莫西林胶囊、甲硝唑片、布洛芬缓释胶囊等药物。
较大囊肿需手术完整摘除囊壁，可能与长期慢性炎症刺激或牙源性上皮残留有关，常伴随患牙松动和咀嚼无力，术后需配合使用头孢克肟分散片、奥硝唑片、对乙酰氨基酚片等药物。
急性感染期需药物控制炎症，可能与细菌感染或免疫反应有关，表现为牙龈肿胀和自发痛，可选用罗红霉素胶囊、替硝唑片、双氯芬酸钠肠溶片等药物辅助治疗。
治疗后需每3-6个月拍摄牙片观察愈合情况，防止囊肿残留或复发，复查期间出现咬合不适需及时就诊。
治疗期间避免用患侧咀嚼硬物，保持口腔卫生，定期进行专业洁牙有助于预防复发。
