急性甲状腺炎治疗效果通常较好，多数患者通过规范治疗可完全恢复。治疗效果主要与感染控制、炎症缓解、甲状腺功能恢复、并发症预防等因素相关。
细菌性甲状腺炎需使用抗生素如阿莫西林克拉维酸钾、头孢呋辛、左氧氟沙星等，病毒性感染以对症治疗为主。
非甾体抗炎药如布洛芬、双氯芬酸钠可减轻疼痛和发热，严重病例需短期使用泼尼松等糖皮质激素。
一过性甲状腺毒症阶段通常无须特殊处理，若出现甲减可短期补充左甲状腺素钠。
需警惕脓肿形成和气管压迫，超声引导下穿刺引流或手术切开可处理化脓性病灶。
治疗期间建议保持颈部制动，避免剧烈活动，选择高热量高维生素饮食帮助恢复，定期复查甲状腺功能和超声。
