蝙蝠粪便在传统医学中被称为夜明砂，主要用于明目退翳、活血消积，可治疗夜盲症、角膜云翳等眼疾，也可外用缓解跌打损伤。
夜明砂含维生素A样物质，能改善视网膜功能，适用于肝血不足导致的夜盲症，常与决明子、谷精草配伍使用。
其破血散结作用可缓解瘀血肿痛，多与当归、红花同用治疗跌打损伤，需研磨成粉后醋调外敷。
对小儿疳积引起的腹胀发热有一定效果，传统用法是与胡黄连、使君子等驱虫药配合使用。
煅烧后的夜明砂粉末可辅助处理创伤出血，但现代临床已较少应用。
使用前须经专业炮制去除病原体，避免直接接触新鲜蝙蝠粪便以防传染病毒，孕妇及体虚者禁用。
