激光眼睛手术后遗症多数较轻微且可控，常见问题包括干眼症、眩光、角膜混浊、夜间视力下降等，严重并发症概率较低。
术后早期约半数患者出现暂时性干眼，与角膜神经暂时性损伤有关，可使用人工泪液缓解，多数3-6个月逐渐恢复。
夜间视物可能出现光圈或星芒现象，多与瞳孔大小或角膜愈合过程相关，90％以上患者6个月内症状明显减轻。
极少数患者发生角膜上皮下雾状混浊，与个体愈合反应相关，可通过激素滴眼液控制，严重者需二次激光治疗。
高度近视患者存在低概率屈光回退风险，多因角膜重塑或用眼习惯不当导致，可通过增效手术或佩戴低度数眼镜矫正。
术后严格遵医嘱使用抗生素滴眼液，避免揉眼及游泳，定期复查可最大限度降低后遗症发生概率。多数视觉质量问题随时间推移逐渐改善。
