醋鳖甲具有滋阴潜阳、软坚散结、退热除蒸等功效，主要用于阴虚潮热、骨蒸盗汗、癥瘕积聚等症状的治疗。
醋鳖甲可改善肝肾阴虚引起的头晕目眩、腰膝酸软，常与牡蛎、龟甲配伍使用，代表方剂如大补阴丸。
针对甲状腺结节、乳腺增生等癥瘕积聚病症，醋鳖甲能抑制结缔组织增生，常与三棱、莪术同用。
对结核病、更年期综合征导致的骨蒸潮热，醋鳖甲通过调节下丘脑体温中枢实现退热，多与青蒿、知母配伍。
现代研究显示醋鳖甲提取物可保护肝细胞，对慢性肝炎、早期肝硬化有辅助治疗作用，常与丹参、三七配合使用。
使用醋鳖甲需中医辨证施治，阴虚体质者可配合山药、枸杞食疗，服药期间忌食辛辣油腻。
