胸腺肽可能引起发热、皮疹、过敏反应、肝功能异常等副作用，通常与个体差异、用药剂量、药物纯度、基础疾病等因素有关。
部分人群对胸腺肽成分敏感，可能诱发免疫过度反应，表现为皮肤瘙痒或局部红肿，轻度症状可停药观察，严重过敏需使用氯雷他定、地塞米松、肾上腺素等药物干预。
超说明书范围大剂量使用可能加重肝肾代谢负担，伴随转氨酶升高或尿量减少，需调整剂量并配合谷胱甘肽、水飞蓟素等保肝药物。
制备工艺差异可能导致杂质残留，引发寒战或注射部位疼痛，建议更换高纯度制剂如胸腺五肽或胸腺法新。
自身免疫性疾病患者使用可能加重原发病情，出现关节肿痛或低热，需联合免疫抑制剂如环孢素、他克莫司进行控制。
用药期间建议定期监测血常规和肝肾功能，出现持续头晕或呼吸困难应立即就医，避免与免疫增强剂同时使用。
