非淋菌性尿道炎可能发生在生殖器以外的部位，主要包括眼结膜、咽部、直肠等黏膜组织，传播途径涉及性接触、母婴垂直传播或间接接触感染。
沙眼衣原体可通过手部接触传播至眼部，表现为结膜充血、分泌物增多。治疗需使用阿奇霉素片、左氧氟沙星滴眼液、红霉素眼膏等药物。
口交行为可能导致咽部黏膜感染，症状为咽痛或异物感。可选用克拉霉素缓释片、罗红霉素胶囊、复方硼砂含漱液进行抗感染治疗。
肛交行为易引发直肠黏膜炎症，出现肛门灼热感或黏液便。治疗推荐多西环素肠溶片、莫西沙星片、甲硝唑栓等药物。
母婴垂直传播可致新生儿结膜炎或肺炎，表现为眼睑肿胀、咳嗽气促。需使用红霉素干混悬剂、头孢克洛颗粒等儿科适用剂型。
确诊后应避免性生活直至治愈，伴侣需同步治疗，日常注意手部清洁与个人用品消毒，出现黏膜部位异常分泌物应及时就医。
