非淋菌性尿道炎可能引起不育，但概率较低。不育风险主要与感染未及时治疗、炎症扩散至生殖系统、输精管阻塞、睾丸附睾炎等因素有关。
非淋菌性尿道炎长期未治疗可能导致病原体上行感染。患者可能出现尿频、尿痛等症状，可遵医嘱使用阿奇霉素、多西环素、左氧氟沙星等药物。
炎症扩散至前列腺、精囊等生殖器官可能影响精子质量。伴随会阴胀痛、血精等症状，需使用抗生素治疗并配合局部理疗。
慢性炎症可能导致输精管瘢痕性狭窄。临床表现为射精量减少，可通过输精管造影确诊，严重者需手术疏通。
病原体侵袭睾丸或附睾可能造成生精功能障碍。患者出现阴囊肿胀疼痛，需卧床休息并静脉注射头孢曲松等药物。
确诊非淋菌性尿道炎后应规范完成抗生素治疗，治疗期间避免性生活，定期复查精液质量，日常保持会阴部清洁干燥。
