预防支原体肺炎可通过保持手卫生、加强通风、避免密切接触感染者、接种疫苗等方式实现。支原体肺炎主要通过飞沫传播，常见于儿童及免疫力低下人群。
勤用肥皂和流动水洗手，尤其在接触公共物品后，可有效减少病原体传播。家长需帮助幼儿规范洗手步骤。
每日开窗通风至少两次，每次半小时以上，降低密闭环境中病原体浓度。学校及托幼机构需特别注意空气流通。
流行季节减少前往人群密集场所，与咳嗽发热者保持一米以上距离。家长发现孩子班级有病例时应加强防护。
流感疫苗和肺炎疫苗虽不能直接预防支原体感染，但能减少混合感染风险。免疫功能低下者可咨询医生是否需要预防性用药。
均衡饮食与规律作息有助于维持免疫力，出现持续咳嗽发热症状应及时就医明确病原体。
