支原体衣原体感染可能自行痊愈，但多数情况下需要医疗干预。病情转归主要与感染部位、免疫状态、病原体毒力、是否规范治疗等因素有关。
泌尿生殖道感染自愈概率较高，而呼吸道感染容易迁延不愈，肺炎支原体感染可能出现持续咳嗽等症状。
免疫功能正常者可能通过自身免疫力清除病原体，但免疫力低下人群如糖尿病患者往往需要抗生素治疗。
高毒力菌株感染易导致症状加重，可能出现发热、脓性分泌物等表现，此时需及时使用阿奇霉素等药物治疗。
不规范用药可能导致耐药性产生，建议完成足疗程治疗，常用药物包括多西环素、左氧氟沙星、克拉霉素等。
出现持续发热、咳脓痰、尿痛等症状时应及时就医，治疗期间避免性生活，保持充足休息和水分摄入。
