上颌窦囊肿多数情况下不会自愈。上颌窦囊肿的处理方式主要有定期观察、药物治疗、穿刺引流、手术切除。
体积较小且无症状的上颌窦囊肿可暂时观察，建议每半年复查鼻窦CT评估变化。
合并感染时可使用克拉霉素缓释片、桉柠蒎肠溶软胶囊、糠酸莫米松鼻喷雾剂控制炎症，但药物无法消除囊肿本身。
对于引起明显压迫症状的囊肿，可在鼻内镜下穿刺抽吸囊液，该方法创伤小但存在复发可能。
经鼻内镜上颌窦囊肿切除术是根治性治疗方案，适用于反复感染或导致面部畸形的病例，术后需定期冲洗鼻腔。
日常应避免用力擤鼻及鼻腔刺激，保持鼻窦通畅，若出现头痛、鼻塞加重等症状需及时复查。
