颌骨角化囊肿开窗术后可能出现术后感染、创口愈合不良、囊肿复发、邻近牙齿损伤等后遗症。
手术创口护理不当可能导致细菌感染，表现为局部红肿热痛，需遵医嘱使用头孢克肟、阿莫西林克拉维酸钾等抗生素治疗。
患者营养状况差或术后护理不当可能影响创面愈合，需加强蛋白质摄入并配合康复新液等促愈合药物局部处理。
囊壁残留或病灶清除不彻底可能导致复发，需定期复查影像学，必要时行二次手术彻底切除。
术中操作可能损伤邻牙牙根或牙周组织，出现牙齿松动或敏感，需进行牙髓治疗或牙齿固定等处理。
术后应保持口腔清洁，避免辛辣刺激饮食，定期复查颌骨CT观察愈合情况，发现异常及时就诊。
