百日咳脑病可能遗留智力障碍、癫痫发作、运动功能障碍、听力视力损害等后遗症，具体表现与脑损伤程度相关。
脑缺氧导致神经元损伤，部分患儿出现认知功能下降或学习困难，需长期进行康复训练及特殊教育干预。
大脑皮层异常放电可引起反复抽搐，需使用丙戊酸钠、左乙拉西坦、拉莫三嗪等抗癫痫药物控制发作。
基底节受损可能导致肌张力异常或肢体瘫痪，物理治疗结合巴氯芬、替扎尼定等肌肉松弛剂可改善症状。
听神经或视神经损伤引发耳聋、视力模糊等症状，需佩戴助听器或视觉辅助设备进行代偿性康复。
建议定期进行神经发育评估，早期介入高压氧治疗及营养神经药物如甲钴胺，同时保证优质蛋白和维生素B族摄入以促进神经修复。
