巴贝虫病可通过避免蜱虫叮咬、加强个人防护、环境治理及高危人群预防接种等方式预防，主要通过蜱虫传播的血液原虫感染引起。
进入草丛或树林时穿长袖衣裤，使用含避蚊胺的驱虫剂，减少皮肤暴露面积，蜱虫叮咬是主要传播途径。
户外活动后及时检查全身皮肤，重点检查腋窝、腹股沟等隐蔽部位，发现蜱虫需用镊子垂直拔出并消毒。
清除居住区周边杂草落叶，定期喷洒杀虫剂控制蜱虫密度，减少宿主动物如啮齿类在生活区的活动。
脾切除患者或免疫功能低下者前往疫区前可咨询预防性用药，但需在医生指导下进行药物预防。
疫区居民应定期进行环境消杀，接触牲畜后及时清洁，出现发热等疑似症状需立即就医进行血液涂片检查。
