胃窦糜烂多数情况下属于轻度胃黏膜损伤，严重程度主要与糜烂范围、是否伴随出血或溃疡、基础疾病控制情况以及患者症状持续时间有关。
局限性的小面积糜烂通常可通过抑酸药（如奥美拉唑）、胃黏膜保护剂（如铝碳酸镁）和促胃肠动力药（如莫沙必利）缓解，若内镜检查显示糜烂灶小于3处且无活动性出血，一般预后良好。
合并呕血、黑便或血红蛋白下降时提示病情较重，需紧急使用质子泵抑制剂静脉注射（如泮托拉唑），必要时行内镜下止血治疗，此类情况可能发展为溃疡甚至穿孔。
合并幽门螺杆菌感染需进行根除治疗（含克拉霉素三联疗法），糖尿病患者或长期服用非甾体抗炎药者糜烂愈合较慢，易反复发作。
超过2个月的上腹痛、饱胀感未缓解可能提示存在萎缩性胃炎或癌前病变，需定期复查胃镜并检测胃蛋白酶原比值。
日常应避免辛辣刺激饮食，规律进食并限制咖啡因摄入，胃窦糜烂患者建议每6-12个月复查胃镜监测黏膜修复情况。
