口腔黏膜扁平苔藓多数情况下可以临床治愈，但存在复发可能。治疗目标以控制症状、减少复发为主，主要方法包括局部药物治疗、免疫调节治疗、物理治疗及生活方式干预。
糖皮质激素软膏如曲安奈德口腔软膏可缓解黏膜炎症，免疫抑制剂他克莫司软膏适用于顽固性病例，镇痛类药物利多卡因凝胶能改善疼痛症状。
系统性使用小剂量泼尼松可控制急性发作，羟氯喹通过调节免疫功能减少病损，严重病例可考虑硫唑嘌呤等免疫抑制剂。
激光治疗有助于促进病损愈合，光动力疗法对糜烂型病变效果显著，冷冻治疗适用于局限性肥厚型病损。
避免辛辣刺激食物和烟草酒精，保持口腔卫生使用软毛牙刷，定期口腔检查监测癌变风险。
建议保持均衡饮食并补充维生素B族，避免精神紧张等诱发因素，长期随访观察病情变化。
