口腔黏膜扁平苔藓多数可以控制症状，治疗方法主要有局部药物治疗、全身免疫调节、物理治疗和中医调理。
糖皮质激素软膏如曲安奈德口腔软膏可缓解炎症，免疫抑制剂他克莫司软膏适用于顽固病例，镇痛类利多卡因凝胶能改善进食疼痛。
严重病例可短期口服泼尼松，免疫调节剂羟氯喹可能改善苔藓样变，需监测肝肾功能。部分患者与自身免疫异常相关，表现为白纹间杂糜烂。
激光治疗促进黏膜修复，冷冻疗法适用于局限型病变，光动力疗法对顽固糜烂型可能有效。物理治疗适合药物控制不佳的角化型病变。
滋阴清热方剂如知柏地黄丸可辅助治疗，针灸选取合谷等穴位调节免疫，中药含漱剂减轻灼痛感。中医认为本病与肝肾阴虚、血瘀相关。
避免辛辣刺激食物，定期口腔检查监测癌变风险，戒烟酒减少黏膜刺激，保持良好作息有助于病情控制。
