桂枝茯苓胶囊可能引起胃肠道不适、皮肤过敏、月经异常及肝肾功能异常等副作用，用药需严格遵医嘱。
部分患者服药后可能出现恶心、腹胀或腹泻，与药物活血化瘀成分刺激胃肠黏膜有关。症状较轻时可调整服药时间至餐后，严重需停药并就医。
偶见皮疹、瘙痒等过敏反应，与个体对药物成分敏感相关。出现过敏症状应立即停药，必要时使用氯雷他定、西替利嗪等抗组胺药物缓解。
该药可能影响内分泌导致经量增多或周期紊乱，尤其长期服用时更易发生。建议定期复查，必要时联用益母草颗粒等调经药物。
罕见情况下可能引发转氨酶升高或尿常规异常，与药物代谢负担有关。用药期间须监测肝肾功能，发现异常需停用并配合护肝片等治疗。
服药期间避免辛辣刺激饮食，出现持续不适及时就诊，孕妇及经期女性禁用本品。
