激光治疗近视总体安全，但需严格评估适应症，主要风险包括干眼症、眩光、角膜瓣并发症、术后回退。
术后早期常见暂时性泪液分泌减少，与角膜神经损伤有关，可使用人工泪液缓解，严重者需短期使用环孢素滴眼液。
夜间视力质量下降多与瞳孔直径过大或光学区设计不足相关，术前需精确测量暗瞳直径，术后可辅助使用缩瞳药物。
板层刀制瓣可能发生游离瓣、皱褶，飞秒激光制瓣降低该风险，出现异常需立即进行角膜瓣复位手术。
高度近视患者更易发生屈光回退，与角膜上皮重塑有关，二次增效手术需间隔半年以上且角膜厚度达标。
术后需严格遵医嘱使用抗生素滴眼液，避免揉眼及游泳，定期复查角膜地形图，高度近视者建议每年检查眼底。
