服用黄连上清丸需注意避免寒凉饮食、过敏体质慎用、孕妇禁用及避免与其他寒性药物联用，建议在医生指导下规范用药。
服药期间避免食用生冷瓜果、冰镇饮品等寒性食物，可能加重药物寒凉属性导致胃肠不适。若出现腹泻或腹痛，可暂停用药并咨询医生调整方案。
含黄连、黄芩等成分可能引发皮疹或呼吸困难等过敏反应。过敏体质者用药前应告知医生病史，出现过敏症状需立即停药并就医。
药物清热泻火功效可能刺激子宫收缩，妊娠期女性服用存在流产风险。备孕或哺乳期女性同样需在医师评估后使用。
与抗生素、降糖药等联用可能影响药效，慢性病患者用药前需提供完整用药史。服药期间出现头晕或心悸应及时就医。
用药期间保持清淡饮食，避免辛辣刺激，服药3天后症状未缓解或加重应复诊调整治疗方案。
