在西医和中医中均有痢疾的的诊断。
西医所指痢疾一般指细菌性痢疾，细菌性痢疾病因主要是通过被污染的饮食、饮用水、食品、或生活接触等感染痢疾杆菌，痢疾杆菌经消化道感染人体，引起结肠粘膜炎症和溃疡，并释放毒素从而出现一系列症状。
中医所指痢疾大致包括西医所指细菌性痢疾、阿米巴痢疾和一些结肠病变，如溃疡性结肠炎等。痢疾的病因常来源于两点：一，外感疫毒，内袭肠胃或湿热之邪阻滞胃肠气机；二：平时爱食肥甘厚味或误食不洁之物，酿成湿热，或夏季恣食生冷瓜果，损伤脾胃，湿热、寒湿及食积之邪内蕴，与肠中污物相结，化为脓血而致本病。
