3个月婴儿肚脐眼发黑可能与脐带残端未完全脱落、局部色素沉着、轻微感染或脐茸等因素有关，通常无须特殊处理，但需保持局部清洁干燥。
1、脐带残留：脐带残端未完全脱落时可能出现黑色结痂，属于正常现象。家长需每日用碘伏棉签轻柔消毒脐窝，避免强行剥离痂皮。
2、色素沉积：部分婴儿脐部皮肤存在先天性色素沉着，表现为局部颜色加深。若无红肿渗液可观察，建议家长避免反复摩擦刺激。
3、局部感染：细菌感染可能导致脐周发黑伴分泌物，需就医排查。医生可能开具莫匹罗星软膏、夫西地酸乳膏等外用抗生素，家长须按医嘱护理。
4、脐茸病变：脐部肉芽组织增生可能呈现深色，需儿科确诊。轻度脐茸可采用硝酸银烧灼治疗，严重者需手术切除。
日常护理中家长应选择透气衣物，洗澡后及时擦干脐部，发现渗血、化脓或异味应立即就医。
