磷酸铝凝胶可能出现便秘、胃肠不适等副作用，多数症状轻微且可逆，主要与个体差异、用药剂量、基础疾病、药物联用等因素有关。
部分患者对铝剂敏感可能引发便秘，建议调整饮食增加膳食纤维摄入，必要时遵医嘱使用乳果糖口服溶液或聚乙二醇电解质散。
长期大剂量使用可能导致血铝升高，表现为乏力或骨痛，需定期监测血铝浓度，可配合使用碳酸钙或维生素D制剂。
肾功能不全者易发生铝蓄积中毒，常伴认知功能障碍，须严格控制用药周期，必要时换用硫糖铝或瑞巴派特。
与四环素类抗生素联用会影响药物吸收，可能加重腹泻症状，建议间隔两小时服用，可替代使用枸橼酸铋钾或替普瑞酮。
用药期间出现持续腹痛或排便异常应及时就医，避免与高酸性食物同服，老年患者建议定期进行肾功能检查。
