肺囊肿切除后可能出现的后遗症包括胸腔积液、胸膜粘连、呼吸功能轻度受限以及术后感染。
手术创伤可能导致胸腔内液体渗出，表现为胸闷或低热，多数可通过胸腔穿刺引流缓解。
胸膜炎症反应可能引发胸膜增厚粘连，可能伴随轻微胸痛，物理治疗和呼吸训练有助于改善。
肺组织切除可能降低肺活量，尤其多见于多发性囊肿切除后，需通过循序渐进的肺康复锻炼恢复。
手术创面可能继发细菌感染，出现发热或咳脓痰，需及时使用抗生素如头孢呋辛、左氧氟沙星或莫西沙星控制。
术后三个月内避免剧烈运动，定期复查胸部CT评估恢复情况，出现持续咳嗽或呼吸困难需及时就医。
