苹果汁久放后部分营养成分会流失，但仍有保留的营养价值。苹果汁中的维生素C、多酚类物质等易氧化成分会随时间减少，而矿物质和部分糖类相对稳定。
苹果汁榨取后，维生素C在接触空气和光照时容易分解，存放时间越长损失越多。多酚类物质也会因氧化作用逐渐降解，导致抗氧化能力下降。糖分和钾、镁等矿物质性质稳定，即使久放也不会明显减少。冷藏可以减缓营养流失速度，但无法完全阻止。玻璃瓶或避光容器比透明塑料瓶更有利于保护营养成分。家庭自制苹果汁建议现榨现喝，市售灭菌包装的保质期较长但开封后仍需尽快饮用。
苹果汁久放后若出现明显变色、变味或絮状沉淀则不宜饮用。饮用存放时间较长的苹果汁时，可搭配新鲜水果或坚果补充流失的营养素。选择添加维生素C的强化苹果汁产品能弥补部分营养损失。日常可将苹果与其他蔬果搭配榨汁，丰富营养素摄入来源。
