南瓜具有多种药用价值，主要包括调节血糖、改善胃肠功能、抗氧化、促进视力健康及辅助利尿消肿等作用。南瓜含有丰富的果胶、类胡萝卜素、维生素及矿物质，其种子和果肉均可入药。
南瓜中的果胶和铬元素有助于延缓碳水化合物吸收，改善胰岛素敏感性。研究表明南瓜多糖可能通过保护胰岛细胞辅助调控血糖，适合糖尿病患者适量食用。需注意不可替代降糖药物。
南瓜果肉富含膳食纤维与果胶，能促进肠道蠕动并保护胃黏膜。对功能性消化不良或轻度胃炎患者，蒸煮后的南瓜可缓解腹胀。其温和特性也适合术后流质饮食过渡。
南瓜含β-胡萝卜素、维生素E及硒等抗氧化成分，能中和自由基，降低氧化应激损伤。这些物质对预防皮肤老化、动脉硬化有一定帮助，建议与富含维生素C的食物搭配食用增强效果。
南瓜中玉米黄质和叶黄素可富集于视网膜，过滤有害蓝光。长期适量摄入有助于延缓黄斑变性，尤其对用眼过度人群有益。建议与少量油脂同食以提高脂溶性成分吸收率。
南瓜籽含钾及葫芦巴碱等成分，能促进钠离子排出，对轻度水肿或高血压患者有辅助调节作用。传统医学常用南瓜籽配伍其他药材治疗泌尿道不适，但严重肾功能异常者需谨慎。
南瓜宜选择成熟度高的品种，避免与富含维生素C分解酶的食物同食。胃肠虚弱者应控制单次摄入量，糖尿病患者需监测血糖变化。药用时建议咨询中医师进行配伍，不可过量依赖食疗作用。日常可制作南瓜粥、蒸南瓜或烘焙南瓜籽，保留营养的同时提升吸收率。
