肠镜检查通常可在门诊完成，少数情况需住院，主要与患者基础疾病、麻醉方式、术后风险等因素有关。
多数常规肠镜在门诊进行，患者完成检查后观察1-2小时无不适即可离院，适用于无严重心肺疾病且选择普通肠镜的健康人群。
需住院的情况包括高龄患者、心肺功能异常者、需无痛麻醉者、疑有穿孔高风险或术中可能需要治疗性操作者，住院便于术前评估与术后监护。
普通肠镜无须住院，但选择静脉麻醉时部分医院要求短期住院，主要考虑麻醉恢复期可能出现呼吸抑制等不良反应。
基础疾病如凝血功能障碍、肠道严重狭窄或活动性出血者建议住院，因可能需紧急处理并发症或延长观察时间。
检查前需按医嘱进行肠道准备，术后24小时避免驾车或高空作业，出现持续腹痛、便血需及时返院复查。
