支原体衣原体感染的表现主要有咳嗽、咽痛、发热、泌尿生殖道症状等。早期可能仅有轻微不适，随病情进展可出现典型症状，严重者可能引发肺炎或盆腔炎等并发症。
干咳或少量黏痰是呼吸道感染的常见表现，夜间加重，可能持续数周。支原体肺炎患者咳嗽剧烈但肺部体征轻微。
咽部充血水肿伴吞咽疼痛，部分患者可见扁桃体渗出物。儿童可能出现声音嘶哑，症状易与普通感冒混淆。
中低度发热多见，体温多在38℃左右，婴幼儿可能出现高热。发热通常持续3-5天，可伴有头痛乏力等全身症状。
衣原体尿道炎表现为尿频尿急，男性可见尿道分泌物，女性可能出现宫颈炎。未经治疗可能上行感染导致盆腔炎或不孕。
出现持续咳嗽伴发热或泌尿系统症状时建议尽早就医，治疗期间注意休息并避免辛辣刺激饮食，性传播感染者需伴侣同治。
