鼻咽囊肿可能由先天性发育异常、慢性炎症刺激、腺体导管阻塞、鼻咽部损伤等原因引起。
胚胎期鼻咽部结构发育异常可能导致囊肿形成，通常无明显症状，若囊肿增大压迫周围组织可出现鼻塞或耳闷感，影像学检查可确诊，较小囊肿无须处理，较大囊肿需手术切除。
反复鼻炎、鼻窦炎等慢性炎症刺激可导致鼻咽部黏膜腺体分泌物潴留，形成潴留性囊肿，常伴随鼻腔分泌物增多，控制炎症后囊肿可能缩小，顽固性囊肿需在内镜下切除。
鼻咽部黏液腺导管因分泌物黏稠或局部水肿发生阻塞，逐渐形成囊肿，可能引起咽部异物感，可通过鼻咽镜明确诊断，无症状者观察随访，有症状者行囊肿揭盖术。
手术创伤或物理化学损伤可能导致鼻咽部腺体导管瘢痕性闭塞，继发囊肿形成，可能合并局部疼痛感，治疗以手术切除为主，同时处理原发损伤因素。
日常需避免用力擤鼻及辛辣饮食刺激，定期复查鼻咽镜观察囊肿变化，出现持续鼻塞或听力下降应及时就诊。
