会厌囊肿的症状主要有咽部异物感、吞咽困难、声音嘶哑、呼吸困难等，按严重程度从早期表现到终末期发展排列。
早期囊肿较小时主要表现为喉咙持续有黏着感或颗粒感，进食后可能加重，囊肿增大后会引起吞咽障碍。
囊肿生长至豌豆大小时会出现吞咽受阻感，进食固体食物时症状明显，可能伴有轻微疼痛。
囊肿压迫声门区会导致发声费力、音色改变，严重时出现间歇性失声，常见于囊肿位于会厌舌面者。
巨大囊肿可能堵塞呼吸道入口，表现为夜间打鼾加重、吸气性喘鸣，紧急情况下可能出现窒息。
日常应避免辛辣刺激饮食，出现进行性呼吸困难需立即急诊处理，多数病例可通过喉镜下微创手术治愈。
