扁平疣激光治疗后存在复发概率，复发风险与病毒清除程度、皮肤屏障修复、免疫状态及术后护理等因素有关。
人乳头瘤病毒未彻底清除时可能复发，表现为原部位或周围出现新疣体，可联合干扰素凝胶、咪喹莫特乳膏等抗病毒药物治疗。
糖尿病或长期使用免疫抑制剂者易复发，伴随抵抗力下降，需通过胸腺肽肠溶片、转移因子口服液等调节免疫。
术后抓挠或接触污染物会导致病毒扩散，需保持创面干燥并使用重组人表皮生长因子凝胶促进愈合。
密切接触感染者或共用物品可能再次感染，表现为群集性丘疹，可外用鬼臼毒素酊、水杨酸软膏等腐蚀性药物。
术后避免紫外线暴晒，加强维生素A及锌元素摄入有助于降低复发风险，出现新皮损需及时复诊。
