中医烧艾可能引起局部灼伤、过敏反应、呼吸道刺激、一氧化碳中毒等副作用，需在专业人员指导下规范操作。
艾灸温度控制不当可能导致皮肤红肿、水疱或浅表烫伤，操作时需保持安全距离并观察皮肤反应，出现灼伤应立即冷敷并就医。
艾叶燃烧产生的烟雾可能引发过敏性鼻炎、皮疹或哮喘发作，过敏体质者应提前测试反应，症状出现时需停用并服用氯雷他定等抗组胺药物。
艾烟中含有的焦油和颗粒物会刺激呼吸道黏膜，诱发咳嗽或咽喉不适，建议在通风环境操作，慢性肺病患者应避免使用。
密闭空间长时间艾灸可能导致头痛、恶心等中毒症状，须确保空气流通，出现症状需立即转移至通风处并监测血氧饱和度。
艾灸后建议饮用温开水促进代谢，避免立即接触冷水，阴虚体质及孕妇等特殊人群应咨询中医师评估适用性。
