肺部真菌感染可能由吸入真菌孢子、免疫力低下、长期使用抗生素或糖皮质激素、基础肺部疾病等原因引起，可通过抗真菌药物、支持治疗、原发病控制等方式干预。
接触霉变环境或鸟粪等可能吸入曲霉、隐球菌等孢子，日常需佩戴口罩并保持环境干燥，确诊后可使用伏立康唑、两性霉素B、卡泊芬净等抗真菌药物。
艾滋病、糖尿病等疾病或放化疗导致免疫缺陷时易感染肺孢子菌，需加强营养并控制基础病，治疗选用复方磺胺甲噁唑、克林霉素联合伯氨喹等方案。
长期使用抗生素破坏菌群平衡或糖皮质激素抑制免疫，可能诱发念珠菌肺炎，应在医生指导下调整用药，严重时采用氟康唑、伊曲康唑或米卡芬净治疗。
慢性阻塞性肺病、肺结核等导致肺结构破坏易继发曲霉球，需积极治疗原发病，伴随咯血等症状时可考虑手术切除联合抗真菌治疗。
避免潮湿环境接触，高危人群出现持续咳嗽、发热等症状应及时进行痰培养或胸部CT检查，严格遵医嘱完成抗真菌疗程。
