肝吸虫病可通过吡喹酮、阿苯达唑等药物治疗，严重者需手术引流。治疗方法主要有药物治疗、手术治疗、饮食调整、预防再感染。
吡喹酮可杀灭肝吸虫成虫，阿苯达唑对幼虫有效，三氯苯达唑适用于耐药病例。需在医生指导下完成疗程。
出现胆道梗阻或肝硬化时需手术，常见方式有胆总管探查术、肝叶切除术。术后仍需配合抗寄生虫治疗。
治疗期间避免生食淡水鱼虾，肉类需彻底煮熟。适量补充优质蛋白和维生素帮助肝功能恢复。
改善饮食卫生习惯，避免接触疫区生水。流行区居民应定期筛查，接触疫水后及时预防性服药。
治疗期间定期复查肝功能，出现黄疸加重或发热需及时复诊。痊愈后仍须保持饮食卫生以防复发。
