黄连上清丸对风热上攻型口腔炎有一定缓解作用，口腔炎常见类型包括轻型阿弗他溃疡、疱疹性口炎、口腔扁平苔藓、放射性口炎等。
黄连上清丸含黄连、黄芩等成分，具有清热泻火功效，适用于舌红苔黄、黏膜充血明显的口腔炎患者，但细菌或病毒感染需配合抗生素或抗病毒药物。
对实热证口腔溃疡可能减轻灼痛感，虚火型口腔炎如阴虚火旺者服用可能加重腹泻，需配伍知柏地黄丸等滋阴药物。
严重感染可联合西地碘含片、重组人表皮生长因子凝胶，复发性口腔溃疡建议搭配维生素B族和锌制剂。
孕妇及脾胃虚寒者禁用，长期使用可能引起胃肠不适，儿童用药需遵医嘱减量，过敏体质者慎用黄芩成分。
出现口腔黏膜糜烂超过两周不愈或伴发热时，应及时就诊排查白塞病等系统性疾病，日常避免辛辣刺激饮食。
