裸眼3D可能导致视疲劳、双眼视觉冲突、暂时性视力模糊等眼部不适，严重时可能诱发头痛或加重近视。影响因素主要有观看时长、屏幕亮度调节、个体屈光状态、环境光线适配等。
长时间聚焦3D影像会导致睫状肌持续紧张，表现为眼干涩和胀痛。建议每隔20分钟远眺6米外景物，可使用玻璃酸钠滴眼液、聚乙烯醇滴眼液、羧甲基纤维素钠滴眼液缓解症状。
左右眼接收不同图像可能引发调节集合失调，出现重影或头晕。儿童神经系统发育未完善更易受影响，家长需控制单次观看不超过15分钟，发现揉眼行为立即暂停使用。
3D成像原理可能干扰正常聚焦功能，尤其屈光不正未矫正者更明显。近视人群应佩戴准确度数的矫正眼镜观看，可备妥妥布霉素滴眼液、左氧氟沙星滴眼液、普拉洛芬滴眼液预防感染。
快速闪烁的光刺激可能诱发光敏性癫痫或偏头痛。有癫痫病史者须严格避免接触，普通人群出现闪光幻觉应立即停止观看并就医检查。
使用裸眼3D设备时保持环境光线柔和，适当补充含维生素A和叶黄素的食物，连续使用不应超过30分钟，青少年应在家长监督下合理使用。
