儿童自闭症可能与遗传因素、脑器质性因素、神经生化因素、免疫性因素有关。儿童自闭症大多不能够治愈，只能缓解。
1、遗传因素：
研究表明，同卵双胞胎患自闭症的比例为36％-96％，明显高于异卵双胞胎0-24％。同胞患病率为2％-3％，比一般人群高50-100倍，提示该病与遗传因素有关。此外，研究表明，约5％的患者患有脆性X染色体综合征，还可能存在其他染色体异常，如15号染色体异常。
2、脑器质性病变：
此类患儿有围生期损伤史，脑电图异常，神经系统炎症和癫痫发作。核磁共振显示部分患儿有第四脑室扩大、小脑蚓部小叶发育不良、脑干萎缩。
3、神经生化因素：
研究发现约1/3的自闭症儿童血液中5-羟色胺升高。这种现象在孩子的亲属中也存在，其重要性和具体意义估计还不清楚。研究还表明，大脑记忆中DA代谢产物和HVA水平的升高与疾病的刻板行为有关，5-羟色胺代谢产物5- HIAA的升高与症状的严重程度有关。
4、免疫学因素：
表现为儿童T淋巴细胞、辅助性T细胞和B淋巴细胞数量减少，T细胞缺乏被抑制和诱导，自然杀伤细胞活性下降。因此，在婴儿期和新生儿期，儿童易受病毒感染，从而导致中枢神经系统的损伤和自闭症。
自闭症又称孤独症。自闭症的治疗以教育干预为主，药物治疗为辅。由于自闭症患者存在多方面的发育障碍和异常情绪行为，医生需要根据患者的具体情况采取教育干预、行为干预、药物治疗等相关综合干预措施。一般治疗主要指行为方式的教育和干预训练。教育的目的是培养独立自主的生活，降低残疾程度，提高生活质量。努力使一部分孩子成年后具备独立学习、工作和生活的能力。目前缺乏针对自闭症核心症状的特效药。药物治疗只能改善自闭症患者的情绪和行为异常，如情绪不稳定、易怒、自信、多动、自伤、攻击性行为等。
