喉咙起疱能否自愈需根据病因判断，多数病毒感染引起的疱疹可自行消退，但细菌感染或免疫异常导致的疱疹需医疗干预。
病毒感染是喉咙起疱最常见的原因，例如柯萨奇病毒、单纯疱疹病毒等引发的疱疹性咽峡炎。这类疾病具有自限性，病程通常持续7-10天，伴随咽痛、低热症状时会逐渐缓解。保持口腔清洁、适量饮用温水、进食流质食物有助于症状改善。若出现持续高热或进食困难，应及时就诊排除合并细菌感染可能。
当喉咙疱疹由链球菌等细菌感染引起时，往往伴随明显脓性分泌物和持续性高热，这种情况需要抗生素治疗。免疫系统异常疾病如白塞病、天疱疮等引起的口腔黏膜疱疹，可能反复发作并伴随皮肤、眼部等多系统损害，须通过免疫调节治疗控制病情。长期不愈的喉咙疱疹还需警惕EB病毒感染等特殊病因。
日常应注意避免辛辣刺激食物，使用淡盐水漱口保持口腔卫生。出现疱疹面积扩大、伴随呼吸困难或超过两周未愈时，应及时到耳鼻喉科或感染科就诊，通过咽拭子培养、血常规等检查明确病因。儿童患者家长需特别注意观察进食量和精神状态变化。
