青蒿素通常不能用于治疗流感病毒感染。青蒿素是从黄花蒿中提取的抗疟疾药物，主要用于治疗疟疾及并发症，对流感病毒无直接抑制作用。流感病毒感染需使用抗病毒药物或对症治疗。
青蒿素的作用机制是通过产生自由基破坏疟原虫的细胞膜结构，但其药理靶点与流感病毒复制周期无交叉。流感病毒属于正黏病毒科，其复制依赖神经氨酸酶和RNA聚合酶，现有抗流感药物如奥司他韦、扎那米韦等均针对这些靶点设计。青蒿素未显示对流感病毒蛋白的抑制作用，临床研究也未证实其抗流感效果。
目前针对流感病毒感染的治疗方案包括神经氨酸酶抑制剂如磷酸奥司他韦胶囊、帕拉米韦氯化钠注射液，以及RNA聚合酶抑制剂如玛巴洛沙韦片。对于轻症患者可选用连花清瘟胶囊、金花清感颗粒等中成药缓解症状。预防方面建议接种流感疫苗，流行季节注意佩戴口罩并保持室内通风。
出现流感症状后应避免自行使用青蒿素类药物，需及时就医明确诊断。流感患者需多饮水、保证休息，体温超过38.5摄氏度时可遵医嘱使用布洛芬混悬液等退热药物。若合并细菌感染，医生可能开具阿莫西林克拉维酸钾片等抗生素治疗。
