艾柱不能直接杀灭流感病毒。流感病毒主要通过飞沫传播，艾柱燃烧产生的烟雾可能对空气有一定净化作用，但无法有效灭活病毒。
艾柱由艾叶加工制成，燃烧时释放的挥发成分如桉油精、樟脑等具有一定抗菌作用，但针对细菌的效果有限。流感病毒属于RNA病毒，其结构特性决定了对物理化学因素的抵抗力较强，常规艾烟温度和作用时间难以破坏病毒蛋白外壳及遗传物质。现有研究未证实艾灸或艾烟对流感病毒有直接灭活效果，预防流感仍需依赖疫苗接种、戴口罩等科学防护措施。
部分传统医学理论认为艾灸可增强免疫力，间接帮助抵抗病毒感染，但缺乏针对流感病毒的特异性证据。若出现发热、咳嗽等流感症状，建议及时就医确诊，避免自行使用艾灸延误治疗。日常保持室内通风，接触公共物品后勤洗手，避免用手触摸口鼻，是更有效的预防手段。
使用艾柱时需注意安全，避免在密闭空间长时间燃烧，防止一氧化碳中毒或引发火灾。孕妇、哮喘患者及过敏体质者应谨慎接触艾烟。流感流行期间，建议优先采用医用酒精消毒常用物品表面，对疑似污染区域可使用含氯消毒剂处理，这些方法对灭活环境中的流感病毒更有效。
