药物流产最后三粒米索前列醇的疼痛程度因人而异，多数人会出现中度腹痛，少数可能痛感剧烈。
服用米索前列醇后，子宫收缩会明显增强以促进妊娠组织排出，这是药物起效的正常反应。疼痛多表现为下腹阵发性绞痛，类似经期痛经加重的情况，可能伴随腰骶部酸胀感。疼痛通常在服药后1-4小时达到高峰，持续时间为2-6小时，部分人会有恶心、呕吐或腹泻等前列腺素副作用。疼痛程度与孕周大小、个人痛阈敏感度相关，孕周较小者多数痛感较轻。
极少数情况下可能出现剧烈疼痛，可能与子宫强烈收缩、宫颈扩张困难或不全流产有关。若疼痛超过可忍受范围、持续超过12小时或伴随大量鲜红色出血，需警惕宫腔残留或大出血风险。既往有痛经史、未生育过的女性可能对疼痛更敏感。
建议服药时准备热水袋热敷腹部，保持卧位休息，可提前备好布洛芬缓释胶囊等止痛药。出现发热超过38℃、出血量超过月经量两倍或组织物排出不全时，须立即返院处理。流产后两周需复查B超确认宫腔清洁，一个月内避免盆浴和性生活。
