原发性纤毛运动障碍目前无法完全治愈，但可通过规范治疗控制症状并改善生活质量。该病属于先天性纤毛结构异常疾病，主要表现为慢性呼吸道感染、男性不育、内脏转位等症状。
针对呼吸道症状，临床常用黏液溶解剂如乙酰半胱氨酸颗粒促进痰液排出，配合布地奈德雾化吸入剂减轻气道炎症。对于反复感染患者可选用阿莫西林克拉维酸钾片等抗生素预防感染加重。支气管扩张严重时需定期进行体位引流，部分患者需要长期氧疗。男性生育问题可通过辅助生殖技术解决，如卵胞浆内单精子显微注射技术。内脏转位若无并发症通常无须特殊处理，但需在就诊时主动告知医生以便调整检查方案。
日常护理需注重预防呼吸道感染，保持室内空气流通并避免接触二手烟。建议接种流感疫苗和肺炎疫苗，冬季注意保暖。适度进行呼吸功能锻炼如腹式呼吸，痰液黏稠时可增加水分摄入。患者应每3-6个月复查肺功能，儿童患者家长需监测生长发育指标。合并鼻窦炎者可用生理海水鼻腔喷雾护理，中耳炎发作时及时耳鼻喉科就诊。
