眼眶CT检查对眼睛的辐射剂量通常控制在安全范围内，一般不会造成明显伤害。但孕妇、儿童等特殊人群需谨慎评估必要性。
现代CT设备采用低剂量扫描技术，单次眼眶CT的有效辐射剂量约为0.4-1毫西弗，相当于自然环境中4-12个月的背景辐射量。眼部晶状体对辐射相对敏感，但常规检查的辐射量远低于可能引发白内障的阈值剂量50毫西弗。检查过程中会使用铅防护罩遮蔽非检查区域，进一步降低散射辐射。健康成年人每年接受1-2次此类检查属于可接受范围。
婴幼儿眼球发育期、孕妇妊娠早期等特殊阶段需严格遵循辐射防护最优化原则。甲状腺功能亢进患者、近期多次接受放射检查者应主动告知医生。若必须进行检查，可采用铅眼镜等额外防护措施。眼科专用CT比普通头颅CT的辐射量更低，必要时可优先选择。
接受检查后无须特殊防护，正常饮食饮水即可帮助代谢。如短期内需重复检查，建议与医生充分沟通替代方案。检查前去除金属饰品可避免伪影干扰，配合技师保持头部静止能减少重复扫描概率。若检查后出现持续眼痛、视力模糊等异常症状，应及时眼科就诊。
