输尿管末端囊肿是否要紧需结合囊肿大小及症状判断，多数情况下体积较小且无症状时不需特殊治疗，若伴随尿路梗阻或感染则需干预。治疗方法主要有观察随访、药物治疗、内镜下切开引流、输尿管再植术等。
体积小于3厘米且无排尿困难、血尿等症状的输尿管末端囊肿通常属于先天性结构异常，可能终身不进展。此类情况建议每6-12个月通过泌尿系统超声复查，日常注意多饮水、避免憋尿。当囊肿引起轻度尿频尿急时，可遵医嘱使用盐酸坦索罗辛缓释胶囊缓解下尿路症状，配合头孢克肟分散片预防感染。
出现反复泌尿系感染或肾积水时提示存在尿流动力学障碍，需行膀胱镜检查评估梗阻程度。对于直径超过3厘米的囊肿，可选择经尿道囊肿电切术解除梗阻，术后留置导尿管3-5天。合并严重输尿管反流者可能需行腹腔镜下输尿管膀胱再植术，通过重建抗反流机制保护肾功能。术后需定期检测尿常规和肾功能指标。
日常应保持每日饮水量2000毫升以上，限制咖啡因及酒精摄入。出现发热伴腰痛、肉眼血尿或尿量明显减少时需立即就医。长期随访中若发现囊肿增大速度超过每年0.5厘米或肾功能进行性下降，应考虑手术治疗干预。
