扁桃体肥大可能随着年龄增长自愈，但并非所有情况都会自行缓解。扁桃体肥大通常与反复感染、过敏或免疫因素有关，部分儿童在青春期后随着免疫系统发育完善，肥大的扁桃体会逐渐缩小。若扁桃体肥大未引起明显症状，可暂不干预；若伴随严重呼吸障碍或反复感染，则需医疗干预。
儿童期扁桃体肥大较常见，因免疫系统尚未成熟，扁桃体作为免疫器官可能代偿性增生。随着生长发育，部分患儿扁桃体会自然萎缩，症状减轻。这一过程可能持续至青春期，期间需观察是否出现睡眠呼吸暂停、吞咽困难或频繁感染。
成人扁桃体肥大自愈概率较低。长期慢性炎症、过敏或免疫异常可能导致扁桃体持续肿大，甚至引发阻塞性睡眠呼吸暂停综合征。此类情况需通过药物控制炎症或手术切除治疗。若合并腺样体肥大或鼻窦炎，需多学科联合处理。
日常应避免辛辣刺激食物，保持口腔清洁，减少呼吸道感染概率。若出现持续打鼾、呼吸困难或每年超过5次扁桃体炎发作，建议尽早就医评估。医生会根据症状严重程度选择保守观察或手术治疗，常用术式包括扁桃体部分切除术和低温等离子消融术。
