十二指肠结核多数情况下可以治愈，治疗方式主要有抗结核药物治疗、营养支持治疗、内镜介入治疗、手术治疗。
1、抗结核药物治疗标准化抗结核方案是治疗核心，常用异烟肼、利福平、吡嗪酰胺、乙胺丁醇四联药物，需持续用药半年以上。
2、营养支持治疗因结核消耗及十二指肠梗阻风险，需高热量高蛋白饮食，必要时采用肠内营养或静脉营养补充。
3、内镜介入治疗出现肠腔狭窄时可通过球囊扩张或支架置入缓解梗阻，同时获取组织标本明确诊断。
4、手术治疗对于严重狭窄、穿孔或出血病例，需行十二指肠部分切除术或胃肠吻合术等外科干预。
治疗期间需定期复查肠镜评估疗效，注意药物肝毒性监测，保持充足营养摄入有助于预后恢复。
